本學程規劃以理學院之物理學系、化學系、微生物學系、心理學系為主軸，結合法學院開設鑑識科學相關課程，主要分為兩部份：
（一）必修課程：鑑識科學導論、鑑識物理學、鑑識化學、鑑識生物學。
（二）選修課程：生物統計(一)(二)、有機分析化學、微量分析、遺傳學、分子生物學、犯罪心理學、刑事鑑定法律、物證鑑定方法 、刑案現場鑑識實務。
課程規劃先由理學院課程委員會負責執行，後來由鑑識科學學程課程委員會接手，邀請法學院和校內外相關學者專家，共同規劃本學程相關必、選修科目。
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