研究事務與國際合作處於94學年度(95年)第二學期設立，以「整合全校教師之研究能量、推動師生國際化腳步、落實校務發展計畫」為願景，以「發展具有前瞻性研究團隊」、「打造優質國際東吳合作平台」、「落實宏觀校務發展計畫」為目標，希望於同仁努力下，能提高本校校務發展及研究能量，將東吳推向卓越大學。
依據未來校務發展推動方向，民國101年8月在因應行政單位組織調整，研務處更名為「研究發展處」(簡稱研發處)，並於102年新增「評鑑組」，由「研究發展長」主持，下設「研究事務組」、「校務發展組」及「評鑑組」，負責本校校務發展規劃與評鑑，並負責推動研究事務與產學合作有關事務。
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