(A)期刊論文

1. Hua, Jian, Yihusan Wu, and HsinLing Chen (2017, May). Alternative fuel for sustainable shipping across the Taiwan Strait. Transportation Research Part D, 52 (2017) 254–276. 【SCI】
2. 吳怡萱、廖烈龍，2014.10。【稅務治理】跨國企業租稅規劃的稅務風險。會計研究月刊，第347期，頁100-107。
3. 吳怡萱、廖烈龍，2014.09。【稅務治理】海外設點之國際租稅案例。會計研究月刊，第346期，頁98-105。
4. 華 健、吳怡萱，2013.09。船運採用替代燃料大氣排放初評。船舶科技，第43期，頁59-78。
5. 華 健、吳怡萱，2012.03。產業水足跡之初評。工業污染防治，第121期，頁1-31。
6. Hua, J., and Y.H. Wu, 2011. Implications of energy use for fishing fleet—Taiwan example, Energy Policy, 39(5), May, pp.2656-2668.【SCI】。
7. 華 健、吳怡萱，2010。船舶大氣排放物減量決策模式。船舶科技，第38期，頁47~56。
8. Hua, J., Y.H. Wu, B.F. Jin. 2008, “Prospects for Renewable Energy for Seaborne Transportation – Taiwan Example”, Renewable Energy, 33(5): pp.1056-1063.【SCI】
9. 吳怡萱、華 健，2008，國際海運減碳趨勢，船舶科技，第36 期。
10. 華 健、吳怡萱。2007。暖化下的海運能源，船舶與海運通訊，第47期。
11. 華 健，吳怡萱，2002，廢潤滑油作為燃料回收之技術評估，工業污染防治，第83 期（July 2002），第79-102 頁。
12. Hua, Jian and Yihsuan Wu, 2000, "The Effect of Carbon Tax on Manufacturing Sectors in Taiwan”, Water, Air and Soil Pollution, 124(3-4), pp. 245-257.【SCI】
13. 華 健、吳怡萱，2000，廢潤滑油再煉製回收技術評估，工業污染防治，第76 期(Oct. 2000)，第56-80 頁。
14. 吳怡萱，2000，歐洲國家溫室氣體自發減量計劃推動經驗，產業溫室氣體減量報導，第六期，頁6-10。

(B) 研討會論文

1. Wu, Yihsuan and J.L. Chen, 2013. Does capital market reward firms' ecoefficiency? Evidence from Taiwanese listed companies. 2013 American Accounting Association Annual Meeting: 14th Annual Ethics Research Symposium, Aug. 3-7, Anaheim, California, USA. 【具審稿性質】
2. 吳怡萱、陳俊良，2013.4。企業市值是否反映其生態效益？台灣上市公司的實證結果。2013首經貿－東吳大學海峽兩岸會計學術研討會，北京，2013年4月14日。
3. 吳怡萱、陳素緞，2012。以會計表達碳排放權交易與溫室氣體排放的責任：爭議與規範迫切性。海峽兩岸財經與商學研討會，台北，2012年10月16日。【具審稿性質】
4. Hua, Jian and Yihsuan Wu, 2010. Economic evaluation of marine shipping’s alternatives for the control of ballast water, The 2nd International Conference of Accounting, Business, Leadership, and Information Management (ICABLIM) 2010, May 14-16, New Orleans, LA, USA. 【具審稿性質】 【Emerald Best paper Award】
5. Hua, Jian and Yihsuan Wu, 2009. Assessing Energy Saving and Atmospheric Emission Reduction Opportunities in Marine Shipping Sector: an Empirical Result from Container Liners, International Symposium on Environmental Science and Technology, June 2 to 6, Shanghai, China. Paper# 2357. 【具審稿性質】
6. Hua, J. and Y. Wu. 2007. Aerial emission from Taiwanese fishing vessel. International Conference on Maritime Technology (ICMT 2007), Taipei. pp.169-176. 【具審稿性質】
7. Hua, J. and Y. Wu. 2007. Used oil recycling management in Taiwan: an overview of ten-year implementation. Resource Recycling Forum–Taiwan’07, 2007.10.03-10.05. Taipei. pp. A5-1-10.
8. 吳怡萱，2004，「海運環保之經濟評估－以CO2 減量為例」，海運與環保研討會，東吳大學，台北，6 月18 日。
9. 吳怡萱，2004，「環境會計在企業環境管理中扮演之角色」，環境會計與企業責任研討會，東吳大學，台北，3 月26 日。
10. 吳怡萱、胡友貞，2003，「企業環境績效與經營績效之關聯性」，環境會計理論與應用研討會，東吳大學，台北，1 月9 日。
11. Hua, Jian and Yihsuan Wu, 2003, “The Impact of Ship Air Pollution Control on the Harbor Operation”, 15th Chinese Naval Architect and Marine Engineering Conference, March 7 and 8, Kaoshung, Taiwan. 【具審稿性質】
12. 華 健、吳怡萱，2002，「管制船舶空氣污染對海峽兩岸港市營運影響：航商靠泊決策分析」，2002 海峽兩岸財經與商學研討會，東吳大學商學院，4 月23 至24 日。【具審稿性質】
13. 華 健、吳怡萱，2000，「船舶空氣污染防制對港市營運影響之研究（Ι）」，89 年度國科會永續會永續發展研究研討會，台大第二學生活動中心，台北，12 月14-15 日。
14. 吳怡萱，2000，「溫室氣體自發減量推動策略研析」，因應氣候變化綱要公約我國環保、產業及能源政策研討會，台北，11 月7-8 日，台灣綜合研究院。
15. Wu, Tsai-Yi, Chein-Ming Lee, and Yihsuan Wu, 2000, “Carbon Dioxide Emission Trading in Taiwan: an Analysis of Feasibility”, IAEE 23rd Annual International Conference, June 7-10, 2000, Sydney, Australia. 【具審稿性質】
16. 吳怡萱，1999，「溫室氣體減量評估模型與政策形成之配適度分析」，排放權交易制度規劃研討會，台北，4 月29 日，行政院經建會、行政院環保署暨台灣綜合研究院。
17. 吳怡萱、華健，1998，「空氣污染排放許可交易制度下企業之因應成本」，1998 會計新環境國際研討會，圓山飯店。台北，5 月12-13 日，東吳大學。【具審稿性質】
18. Wu, Yihsuan and Jian Hua, 1998. “Economic Impact of Carbon Taxes on the Energy Consumption Pattern of Taiwan‘s Manufacturing Sector”, Proceedings of Conference on East Asian Environmental and Resource Economics and Policy, The Institute of Economics, Academia Sinica, Taipei, March 2-3, 1998. 【具審稿性質】

(C) 專書、技術報告、學位論文

1. 華 健、吳怡萱，2013.12，再生能源概論，第二版，五南，ISBN 978-957-11-7375-7。
2. 華 健、吳怡萱，2009，能源與永續，五南，ISBN 978-957-11-5854-9。
3. 華 健、吳怡萱，2008，再生能源概論，五南，ISBN 978-957-11-5246-2。
4. 華 健、張四立、李清華、吳怡萱、溫麗琪，2002，「廢潤滑油回收處理費率檢討」，行政院環境保護署研究計畫，海洋大學執行。
5. 華 健、吳怡萱，2002，船舶空氣污染防制對港市營運影響之研究（II），國科會專案研究計劃，海洋大學執行。
6. 華 健、吳怡萱，2000，船舶空氣污染防制對港市營運影響之研究（I），國科會專案研究計劃，海洋大學執行。
7. 林大侯、吳再益、李堅明、蔡希賢、吳怡萱等，2000，「因應氣候變化綱要公約我國產業發展策略研究規劃－各國製造業自發遵循減量之推動規劃與成效評估」，經濟部工業局委辦計畫，台灣綜合研究院。
8. 華 健、吳怡萱等，1999，「廢潤滑油回收處理體系之規劃與費率之訂定」，行政院環境保護署研究計畫，海洋大學執行。
9. 吳再益、李堅明、吳怡萱等，1999，「因應氣候變化綱要公約我國二氧化碳減量成本之經濟評估」，環保署委辦計畫，台灣綜合研究院。
10. 華 健、吳怡萱，1998，「源自船舶之空氣污染及其防制」，行政院環保署研究計畫期末報告epa-87-FS44-09-19。
11. 華 健、吳怡萱，1998，「燃油品質對船舶空氣污染之影響」，行政院環保署研究計畫期末報告epa-87-FS44-09-20。
12. 吳再益、李堅明、吳怡萱、許政邦等，1998，「因應京都議訂書之我國產業調整與執行方案之研究」經濟部工業局委辦計畫，台灣綜合研究院。
13. Wu, Yihsuan, 1997. Economic Impact of Carbon Taxes on Taiwan‘s Manufacturing Sector, PhD Dissertation, Kansas State University.
14. 華 健、吳怡萱，1997，「以可轉讓排放許可防制空氣污染之可行性分析」，行政院環境保護署研究計畫epa-86-FA44-09-39。
15. 華健、林春霖、吳怡萱，1993，「農產品批發市場之污染防治研究」，農產品批發市場污染防治開發研究計畫專輯，行政院農業委員會，p103-128。

16. Wu, Yihsuan, 1990.Hedging Effectiveness of Currency Futures, Master Thesis, Kansas State University.