本研究中心的設立，具有下列三個重要的目的:
(ㄧ) 配合科技整合發展趨勢及東吳大學校務發展目標，提升跨領域研究能量。
(二) 整合现有資源及人力，促成中東歐相關議題的教學與研究，建立本校的學術發展特色。
(三) 透過研究與教學活動，培養熟悉中東歐事務的專才，促進台灣與中東歐交流與合作。
據此，本研究中心以中東歐區域，主要包括匈牙利，斯洛伐克，捷克與波蘭等國為研究領域，研究的主題與方向如下:
(一)中東歐各國的歷史演變及特色。
(二)中東歐各國的社會與文化發展及問題。
(三)中東歐各國的社會政策發展及其比較。
(四)改革開放後中東歐各國的民主化過程。
(五)改革開放後中東歐各國的市場經濟形成。
(六)後社會主義國家的政治，經濟，社會及文化發展的比較。
(七)歐盟東擴的現象及問題。
(八)其他相關中東的問題及現象。
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